Кафедра организована в октябре 1936 г. под руководством Николая Александровича Шерстенникова, ученика первого Наркома здравоохранения РСФСР Н.А. Семашко. В 1967 г. году кафедра переименовалась в кафедру социальной гигиены и организации здравоохранения. С 1970 г. ее возглавляет доцент Махмут Салихович Сафин, по инициативе и при личном участии которого был создан музей БГМУ.
В 1987-1997 гг. кафедрой руководит доцент Леонид Васильевич Голубев, с 1997 г. – доктор медицинских наук, профессор, заслуженный деятель науки РБ Ильмира Минулловна Харисова. В 2003 г. кафедра переименовалась в кафедру общественного здоровья и организации здравоохранения с курсами менеджмента сестринского дела и ИПО.
В 2007 г. кафедру возглавила Назира Хамзиновна Шарафутдинова, доктор медицинских наук, профессор.
В настоящее время на кафедре работают 12 штатных преподавателей, из них: 1 профессор, 7 доцентов, 1 ст. преподаватель, 2 ассистента.
Кафедра имеет 10 учебных комнат (с компьютерным классом), с общей площадью 373,3 м2. Занятия с интернами и клиническими ординаторами проводятся в комнатах медицинского информационно-аналитического центра РБ и МБУЗ ГКБ № 18. Имеются кабинеты тематических учебных модулей: медицинская статистика (компьютерный класс, оснащенный 12 персональными компьютерами), история медицины, управление здравоохранением, организация медицинской помощи, общественное здоровье, социальная работа, кроме этого кабинет для самостоятельной внеаудиторной работы студентов.
Кафедра размещается по адресу г. Уфа, ул. Ленина, 3, в главном корпусе университета на первом этаже, телефон – 272-42-21, факс – 272-29-62.